Cell同期發(fā)表多篇外泌體與細(xì)胞外RNA文章
添加時(shí)間:2019-05-20 17:14:54
來(lái)源:外泌體資訊網(wǎng)
最新一期的Cell雜志上,同期發(fā)表了7篇外泌體與細(xì)胞外RNA(exRNA)文章。內(nèi)容包括外泌體PD-L1、外泌體組成重新評(píng)估、exRNA在多種體液/多種細(xì)胞外組分中的精細(xì)分析等。其中,2篇關(guān)于外泌體的Featured Articles,2篇關(guān)于exRNA的Resources,perspective、minireview和preview各1篇。
Poggio M, Hu T, Pai CC, Chu B, Belair CD, Chang A, Montabana E, Lang UE, Fu Q, Fong L, Blelloch R. Suppression of Exosomal PD-L1 Induces Systemic Anti-tumor Immunity and Memory. Cell. 2019 Apr 4;177(2):414-427.e13. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.016.
該研究發(fā)現(xiàn)腫瘤來(lái)源的外泌體上的PD-L1參與了腫瘤細(xì)胞的免疫治療逃避。重要的是,對(duì)于一些PD-L1抗體治療效果不佳的腫瘤類型,通過(guò)抑制外泌體PD-L1分泌并同時(shí)進(jìn)行PD-L1抗體治療,能夠?qū)崿F(xiàn)良好的抗腫瘤免疫治療。
前期詳細(xì)報(bào)道:Cell大發(fā)現(xiàn)丨抑制外泌體PD-L1的分泌有助于腫瘤免疫治療
Jeppesen DK, Fenix AM, Franklin JL, Higginbotham JN, Zhang Q, Zimmerman LJ, Liebler DC, Ping J, Liu Q, Evans R, Fissell WH, Patton JG, Rome LH, Burnette DT, Coffey RJ. Reassessment of Exosome Composition. Cell. 2019 Apr 4;177(2):428-445.e18. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.029.
該研究根據(jù)嚴(yán)格的分離方法對(duì)外泌體組成進(jìn)行了重新評(píng)估,確定了蛋白質(zhì)、RNA和DNA在小細(xì)胞外囊泡和非囊泡細(xì)胞外物質(zhì)之間的差異分布,并確定小細(xì)胞外囊泡不是活躍的DNA釋放載體,annexin A1是經(jīng)典質(zhì)膜形成的微泡的一個(gè)標(biāo)志蛋白。
詳細(xì)報(bào)道見(jiàn)本期頭條。
Pluchino S, Smith JA. Explicating Exosomes: Reclassifying the Rising Stars of Intercellular Communication. Cell. 2019 Apr 4;177(2):225-227. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.020.
這是一篇針對(duì)Reassessment of Exosome Composition研究文章的preview。
Murillo OD, Thistlethwaite W, Rozowsky J, Subramanian SL, Lucero R, Shah N, Jackson AR, Srinivasan S, Chung A, Laurent CD, Kitchen RR, Galeev T, Warrell J, Diao JA, Welsh JA, Hanspers K, Riutta A, Burgstaller-Muehlbacher S, Shah RV, Yeri A, Jenkins LM, Ahsen ME, Cordon-Cardo C, Dogra N, Gifford SM, Smith JT, Stolovitzky G, Tewari AK, Wunsch BH, Yadav KK, Danielson KM, Filant J, Moeller C, Nejad P, Paul A, Simonson B, Wong DK, Zhang X, Balaj L, Gandhi R, Sood AK, Alexander RP, Wang L, Wu C, Wong DTW, Galas DJ, Van Keuren-Jensen K, Patel T, Jones JC, Das S, Cheung KH, Pico AR, Su AI, Raffai RL, Laurent LC, Roth ME, Gerstein MB, Milosavljevic A. exRNA Atlas Analysis Reveals Distinct Extracellular RNA Cargo Types and Their Carriers Present across Human Biofluids. Cell. 2019 Apr 4;177(2):463-477.e15. doi: 10.1016/j.cell.2019.02.018.
該報(bào)道展示了一份來(lái)自五種人類生物體液(血清、血漿、腦脊液、唾液和尿液)的細(xì)胞外RNA圖譜,顯示了六種細(xì)胞外RNA載體類型,包括囊泡載體和非囊泡載體。
為了開(kāi)發(fā)細(xì)胞外RNA (exRNA)介導(dǎo)的細(xì)胞間通訊圖譜,NIH細(xì)胞外RNA通訊聯(lián)盟(Extracellular RNA Communication Consortium)創(chuàng)建了exRNA圖譜資源(https://exrna-atlas.org)。Atlas版本4P1包含來(lái)自19項(xiàng)研究的5309個(gè)exRNA-seq和exRNA qPCR概要文件,以及一套分析和可視化工具。通過(guò)分析,該研究得到了一個(gè)包含六種exRNA類型(CT1、CT2、CT3A、CT3B、CT3C、CT4)的模型,每種exRNA類型都可以在多種生物體液(血清、血漿、腦脊液、唾液、尿液)中檢測(cè)到。五種exRNA類型與已知的囊泡和非囊泡(脂蛋白和核糖核酸蛋白) exRNA載體有關(guān)。
Srinivasan S, Yeri A, Cheah PS, Chung A, Danielson K, De Hoff P, Filant J, Laurent CD, Laurent LD, Magee R, Moeller C, Murthy VL, Nejad P, Paul A, Rigoutsos I, Rodosthenous R, Shah RV, Simonson B, To C1, Wong D, Yan IK, Zhang X, Balaj L, Breakefield XO, Daaboul G, Gandhi R, Lapidus J, Londin E, Patel T, Raffai RL, Sood AK, Alexander RP, Das S, Laurent LC. Small RNA Sequencing across Diverse Biofluids Identifies Optimal Methods for exRNA Isolation. Cell. 2019 Apr 4;177(2):446-462.e16. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.024.
由于缺乏關(guān)于細(xì)胞外RNA (exRNA)分離方法性能的認(rèn)識(shí),導(dǎo)致研究的重復(fù)性差,阻礙了exRNA領(lǐng)域的進(jìn)展。通過(guò)對(duì)5種生物液體中10種exRNA分離方法的系統(tǒng)比較,發(fā)現(xiàn)所得到的小RNA-seq圖譜的復(fù)雜性和重現(xiàn)性存在顯著差異。每種方法對(duì)不同的exRNA載體亞類的相對(duì)效率是通過(guò)估計(jì)細(xì)胞外囊泡(EV)-、核糖核蛋白(RNP)-和高密度脂蛋白(HDL)特異性miRNA在每個(gè)圖譜中的比例來(lái)確定的。開(kāi)發(fā)了一種基于web的交互式應(yīng)用程序(miRDaR),以幫助研究人員為他們的研究選擇最佳的exRNA分離方法。這些結(jié)果將提高可重復(fù)性,并促進(jìn)exRNA生物標(biāo)志物的進(jìn)一步發(fā)展。
Das S; Extracellular RNA Communication Consortium, Ansel KM, Bitzer M, Breakefield XO, Charest A, Galas DJ, Gerstein MB, Gupta M, Milosavljevic A, McManus MT, Patel T, Raffai RL, Rozowsky J, Roth ME, Saugstad JA, Van Keuren-Jensen K, Weaver AM, Laurent LC. The Extracellular RNA Communication Consortium: Establishing Foundational Knowledge and Technologies for Extracellular RNA Research. Cell. 2019 Apr 4;177(2):231-242. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.023. Review.
這是一篇關(guān)于exRNA的perspective。細(xì)胞外RNA通訊聯(lián)盟(ERCC)的啟動(dòng)是為了加快細(xì)胞外RNA (exRNA)生物學(xué)新領(lǐng)域的進(jìn)展,并確定exRNAs及其載體,包括細(xì)胞外小泡(EVs)是否能夠介導(dǎo)細(xì)胞間通訊并用于臨床應(yīng)用。
L?sser C. Mapping Extracellular RNA Sheds Lights on Distinct Carriers. Cell. 2019 Apr 4;177(2):228-230. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.027.
這是一篇關(guān)于exRNA的minireview。
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