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Exosome:臨床樣本研究實驗設(shè)計和正常對照

添加時間:2019-01-14 17:09:13

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臨床樣本取樣正確與否直接關(guān)系到下游實驗檢測。很多因素會影響樣本質(zhì)量,需要格外注意。


實驗組:

三種實驗分別需要不同水平的對照和流程,需要根據(jù)研究的問題設(shè)定流程。

a.科研類實驗需要研究外泌體的數(shù)量,大小,exRNA cargo,蛋白質(zhì)組,脂質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué),糖原組學(xué)和其他的體液特征。尤其在篩選外泌體的亞群的分子標(biāo)記,或者通過大小結(jié)構(gòu)電荷分離,需要注意實驗應(yīng)具有重復(fù)性。比如應(yīng)減少血小板和中性白細(xì)胞來源的外泌體。

b.診斷類實驗是需要研究疾病進(jìn)程與biormarker特異性和數(shù)量相關(guān)性特征。為了驗證特異性和檢測Marker的相關(guān)性,在外泌體分離時必須要檢測特定的臨床病理體液樣本。與目前的診斷手段相比,這類研究,能夠提高檢驗敏感性,減少費(fèi)用或降低發(fā)病率。

c.制備類實驗是為病人制備外泌體的研究。這需要最高水平的標(biāo)準(zhǔn),即需要保留外泌體的功能,還需要純化的外泌體。


對照組:

對照組應(yīng)該與病人(性別,年齡等相符),另外還有很多因素都與外泌體的分泌有關(guān),包括年齡、性別、種族、體重系數(shù) (body mass index,BMI) 和用藥(比如口服避孕藥)。另外,女性還需要考慮懷孕與否,是否多胎妊娠等??崭购筒秃鬆顟B(tài)影響血漿脂蛋白和外泌體的水平。另外,患病如感冒也應(yīng)該考慮,因為急性感染會影響circulating cells 和 RNA。樣本采集前是否進(jìn)行體育鍛煉,是否進(jìn)行過肝素治療應(yīng)該考慮,因為會影響下游PCR反應(yīng),影響外泌體與受體細(xì)胞的結(jié)合。

 

Q:同一樣本的進(jìn)行多次重復(fù)檢測是否可以用來做計算樣本間差異(individual differences)?

A:不可以。同一樣本取樣后分裝,可以用來驗證外泌體的分離效果,RNA提取和后續(xù)檢測的操作差異性;或者從同一樣本多個時間點(diǎn)取樣可以用來檢測特定外泌體 marker的時間差異性。但是還有一種情況就是,同一癌癥病人手術(shù)前樣本和手術(shù)后的樣本是可以配對的,或者感染前和感染后的同一樣本可以配對比較。


備注:

年齡

性別

種族

女性:懷孕、妊娠、排卵周期、絕經(jīng)期。

住院(目前)

抗凝治療

肝素治療

肝素類似物

阿司匹林

外周靜脈凝血疾病,肺(肺栓塞)

目前用藥清單

抽煙

濫用藥物

每周運(yùn)動情況

每天工作或家庭活動

堅持體育鍛煉<每周3h

堅持體育鍛煉>每周3h

睡眠情況

最后的飲食、飲水情況

其他飲食因素


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